第三次全国土壤普查目的是查清土壤理化性状、土壤质量和障碍退化状况等，更新完善全国土壤基础数据，形成数据、图件、文字、数据库和样品库等成果，全面摸清士壤质量家底。

集团累计投资8亿多元建成了基础实验中心、沪灞土体有机重构核心试验区、富平中试基地、秦岭野外监测中心站、秦创原自然资源部土地工程技术创新中心和杨凌耕地保护与质量提升创新中心六大科研场所,建立了外业调查采样-样品入库-制备流转-内业检测-成果集成与转化的三普全链条服务，形成了基础理论研究、核心技术研发、成果转化与应用的平台支撑,为三普工作开展以及后续成果转化奠定了坚实的基础支撑。

集团在土体普探、调查与监测平台建设方面获批各类知识产权近百项，颁布相关地方标准多项，所转化的技术成果助力陕西省第三次全国土壤普查，为粮食安全奠定了坚实的技术支撑。

2022年陕西省第三次全国土壤普查共设置6个试点县和3个县的盐碱地专项,集团承担神木和旬阳两个试点的普查工作占全省试点任务的40%。